Datos de la tesis doctoral

Facultad de Informática

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DATOS DE LA TESIS
Titulo Minería de Texto aplicada a Bioinformática Funcional
Doctorando Mariana Lara Neves
Director(es) Alberto Pascual Montano
Universidad Universidad Complutense de Madrid
Año de lectura 2012
Doctorado europeo (si/no) No


Publicaciones de la tesis


a) Revistas


AUTORES Kano Y, Björne J, Ginter F, Buyko E, Hahn U, Cohen K B, Verspoor K, Roedor C, Hunter L E,
Kilicoglu H, Bergler S, Van Landeghem S, Van Parys T, Van de Peer Y, Miwa M, Ananiadou S,
Neves M, Pascual-Montano A, Özgür A, Radev D R, Riedel S, Sætre R, Chun H-W, Kim J-D,
Pyysalo S, Ohta T, and Tsujii J
Nº DE AUTORES 27
TÍTULO U-Compare Bio-Event Meta-Service: Compatible BioNLP Event Extraction Services
CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor) Artículo
NOMBRE DE LA REVISTA BMC Bioinformatics
VOLUMEN 12:481
PÁGINAS DESDE 1
HASTA 9
EDITORIAL BioMed Central
PAÍS DE PUBLICACIÓN Reino Unido
AÑO DE PUBLICACIÓN 2011
ISSN 1471-2105
INDICIOS DE CALIDAD AREA de JCR: MATHEMATICAL &
COMPUTATIONAL BIOLOGY
ÍNDICE DE IMPACTO: = 3.029
POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 4
Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 37
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 4
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Rebholz-Schuhmann D, Jimeno A, Li Ch, Kafkas S, Lewin I, Kang N, Corbett P, Milward D,
Buyko E, Beisswanger E, Hornbostel K, Kouznetsov A, Witte R, Laurila J B, Baker Ch JO,
Kuo Ch, Clematide S, Rinaldi F, Farkas R, Móra G, Hara K, Furlong L, Rautschka K,
Neves M L, Pascual-Montano A, Wei Q, Collier N, Mahbub Chowdhury F, Lavelli A, Berlanga R,
Morante R, Van Asch V, Daelemans W, Marina J L, van Mulligen E, Kors J and Hahn U
Nº DE AUTORES 38
TÍTULO Assessment of NER solutions against the first and second CALBC Silver Standard Corpus
CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor) Artículo
NOMBRE DE LA REVISTA Journal of Biomedical Semantics
VOLUMEN 2(Suppl 5):S11
PÁGINAS DESDE 1
HASTA 12
EDITORIAL BioMed Central
PAÍS DE PUBLICACIÓN Reino Unido
AÑO DE PUBLICACIÓN 2011
ISSN 2041-1480
INDICIOS DE CALIDAD AREA de JCR:
ÍNDICE DE IMPACTO:
POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA:
Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA:
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 11
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Neves M L, Carazo J M and Pascual-Montano A
Nº DE AUTORES 3
TÍTULO Moara: a Java library for extracting and
normalizing gene and protein mentions
CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor) Artículo
NOMBRE DE LA REVISTA BMC Bioinformatics
VOLUMEN 11:157
PÁGINAS DESDE 1
HASTA 13
EDITORIAL BioMed Central
PAÍS DE PUBLICACIÓN Reino Unido
AÑO DE PUBLICACIÓN 2010
ISSN 1471-2105
INDICIOS DE CALIDAD AREA de JCR: MATHEMATICAL &
COMPUTATIONAL BIOLOGY
ÍNDICE DE IMPACTO: 3.029
POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 4
Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 37
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 11
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Smith L, Tanabe L K, Ando R J, Kuo C-J, Chung I-F, Hsu C-N, Lin Y-S, Klinger R, Friedrich C M,
Ganchev K, Torii M, Liu H, Haddow B, Strubble C A, Povinelli R J, Vlachos A, Baumgartner W A,
Hunter L, Carpenter B, Tsai R, Dai H-J, Liu F, Chen Y, Sun C, Katrenko S, Adriaans P, Blaschke C,
Torres Perez R, Neves M, Nakov P, Divoli A, Mana M, Mata-Vazquez J and Wilbur W J
Nº DE AUTORES 34
TÍTULO Overview of BioCreative II Gene Mention Recognition
CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor) Artículo
NOMBRE DE LA REVISTA Genome Biology
VOLUMEN 9(Suppl 2):S2
PÁGINAS DESDE 1
HASTA 193
EDITORIAL BioMed Central
PAÍS DE PUBLICACIÓN Reino Unido
AÑO DE PUBLICACIÓN 2008
ISSN 1465-6906
INDICIOS DE CALIDAD AREA de JCR: BIOTECHNOLOGY & APPLIED MICROBIOLOGY
ÍNDICE DE IMPACTO: 6.885
POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 11
Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 160
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 93
OTROS INDICIOS (si se sabe):


b) Libros


AUTORES Neves M, Carazo J M and Pascual-Montano A
Nº DE AUTORES 3
TÍTULO Extracting and normalizing gene/protein mentions with the flexible and trainable Moara Java library
CLAVE (libro completo, capítulo de libro, editor, prólogo, otros) Capítulo de libro
VOLUMEN 6004
COLECCIÓN Lecture Notes on Bioinformatics: Linking, Literature, Information, and Knowledge for
Biology
PÁGINAS DESDE 71
HASTA 80
EDITORIAL Springer
PAÍS DE PUBLICACIÓN Alemania
AÑO DE PUBLICACIÓN 2010
ISBN 978-3-642-13130-1
INDICIOS DE CALIDAD Nº DE CITAS(si se sabe, excl. autocitas):
RESEÑAS EN REVISTAS CIENTÍFICAS:
TRADUCCIONES A OTRAS LENGUAS:
OTROS INDICIOS (si se sabe):


c) Ponencias


AUTORES Neves M, Carazo J M and Pascual-Montano A
TÍTULO Moara project: a flexible and trainable Java library for the gene/protein recognition and normalization tasks
ENTIDAD ORGANIZADORA International Society for Computational Biology
CONGRESO: BioLINK'09, ISBM/ECCB
TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro) Ponencia - Paper
ISSN/ISBN
VOLUMEN
PÁGINAS DESDE 241
HASTA 244
LUGAR DE CELEBRACIÓN Estocolmo, Suecia
FECHA DE CELEBRACIÓN 01/09
INDICIOS DE CALIDAD Nombre del ranking donde se incluye el congreso: CORE
Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+): A
Posición del congreso en el ranking (si existe):
Nº de congresos en el ranking (si existe):
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Neves M, Carazo J M and Pascual-Montano A
TÍTULO Extraction of biomedical events using case-based reasoning
ENTIDAD ORGANIZADORA Association for Computational Linguistics
CONGRESO: BioNLP'09 Shared Task on Event Extraction Workshop at NAACL-HLT
TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro) Ponencia
ISSN/ISBN
VOLUMEN
PÁGINAS DESDE 68
HASTA 76
LUGAR DE CELEBRACIÓN Boulder, CO, EEUU
FECHA DE CELEBRACIÓN 06/09
INDICIOS DE CALIDAD Nombre del ranking donde se incluye el congreso: CORE
Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+): A
Posición del congreso en el ranking (si existe):
Nº de congresos en el ranking (si existe):
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 10
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Neves M, Chagoyen M, Carazo J M and Pascual-Montano A
TÍTULO CBR-Tagger: a case-based reasoning approach to the gene/protein mention problem
ENTIDAD ORGANIZADORA Association for Computational Linguistics
CONGRESO: BioNLP 2008 Workshop at ACL
TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro) Poster
ISSN/ISBN
VOLUMEN
PÁGINAS DESDE 108
HASTA 109
LUGAR DE CELEBRACIÓN Columbus, OH, EEUU
FECHA DE CELEBRACIÓN 06/08
INDICIOS DE CALIDAD Nombre del ranking donde se incluye el congreso: CORE
Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+): A
Posición del congreso en el ranking (si existe):
Nº de congresos en el ranking (si existe):
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 7
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Neves M, Chagoyen M, Carazo J M and Pascual-Montano A
TÍTULO A new methodology for gene normalization using a mix of taggers, global alignment matching and document similarity disambiguation
ENTIDAD ORGANIZADORA
CONGRESO: VIII Jornadas de Bioinformatica
TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro) Ponencia - paper
ISSN/ISBN
VOLUMEN
PÁGINAS DESDE
HASTA
LUGAR DE CELEBRACIÓN Valencia, España
FECHA DE CELEBRACIÓN 04/04
INDICIOS DE CALIDAD Nombre del ranking donde se incluye el congreso:
Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):
Posición del congreso en el ranking (si existe):
Nº de congresos en el ranking (si existe):
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 1
OTROS INDICIOS (si se sabe):


AUTORES Neves M L
TÍTULO Identifying Gene Mentions by Case-Based Classification
ENTIDAD ORGANIZADORA
CONGRESO: Second BioCreative Challenge Evaluation Workshop
TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro) Ponencia - paper
ISSN/ISBN
VOLUMEN
PÁGINAS DESDE 77
HASTA 79
LUGAR DE CELEBRACIÓN Madrid, España
FECHA DE CELEBRACIÓN 05/07
INDICIOS DE CALIDAD Nombre del ranking donde se incluye el congreso:
Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):
Posición del congreso en el ranking (si existe):
Nº de congresos en el ranking (si existe):
Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 5
OTROS INDICIOS (si se sabe):