Datos de la tesis doctoral

DATOS DE LA TESIS

Titulo

Optimización de la Factorización de Matrices no Negativas en Bioinformática

Doctorando

Edgardo Manuel Mejía Roa

Director(es)

Alberto Pascual Montano y Francisco Tirado Fernández

Universidad

Universidad Complutense de Madrid

Año de lectura

2016

Doctorado europeo (si/no)

No

Publicaciones de la tesis

a) Revistas

AUTORES

E. Mejía-Roa, P. Carmona-Sáez, R. Nogales, C. Vicente, M. Vázquez, X. Y. Yang, C. García, F. Tirado, A. Pascual Montano

Nº DE AUTORES

9

TÍTULO

bioNMF: a web-based tool for Nonnegative Matrix Factorization in Biology

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Nucleic Acids Research

VOLUMEN

152 (Supl. 2, Web Server issue)

PÁGINAS

DESDE W-523

HASTA W-528

EDITORIAL

Oxford University Press

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Reino Unido

AÑO DE PUBLICACIÓN

2008

ISSN

1362-4962

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: Biochemistry & Molecular Biology

ÍNDICE DE IMPACTO: 6,878

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 33

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 275

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 6

OTROS INDICIOS (si se sabe): Para el año 2014 ocupa el puesto 20 de un total de 289 revistas, con un índice de impacto de 9,112.

AUTORES

E. Mejía-Roa, D. Tabas, J. Setoain, C. García, F. Tirado, A. Pascual-Montano

Nº DE AUTORES

6

TÍTULO

NMF-mGPU: Non-negative Matrix Factorization on Multi-GPU systems

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

BMC Bioinformatics

VOLUMEN

16

PÁGINAS

DESDE 43

HASTA 55

EDITORIAL

BioMed Central Ltd.

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Reino Unido

AÑO DE PUBLICACIÓN

2015

ISSN

1471-2105

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: Mathematical & Computational Biology

ÍNDICE DE IMPACTO: 2,576

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 10

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 56

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

b) Libros

AUTORES

E. Mejía-Roa, C. García, J. I. Gómez, M. Prieto, C. Tenllado, A. Pascual-Montano, F. Tirado

Nº DE AUTORES

7

TÍTULO

Parallelism on the Nonnegative Matrix Factorization

CLAVE (libro completo, capítulo de libro, editor, prólogo, otros)

Capítulo de libro

VOLUMEN

COLECCIÓN

Applications, Tools and Techniques on the Road to Exascale Computing (vol. 22 of Advances in Parallel Computing)

PÁGINAS

DESDE 421

HASTA 428

EDITORIAL

IOS Press BV

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Holanda

AÑO DE PUBLICACIÓN

2012

ISBN

978-1-61499-041-3

INDICIOS DE CALIDAD

Nº DE CITAS(si se sabe, excl. Autocitas):

RESEÑAS EN REVISTAS CIENTÍFICAS:

TRADUCCIONES A OTRAS LENGUAS:

OTROS INDICIOS (si se sabe):

c) Ponencias

AUTORES

E. Mejía-Roa, J. I. Gómez, M. Prieto, A. Pascual-Montano, F. Tirado

TÍTULO

Programacion bajo un modelo basado en flujos. La factorizacion NMF como caso de estudio

ENTIDAD ORGANIZADORA

Universidad de Castilla-La Mancha

CONGRESO:

XVII Jornadas de Paralelismo

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), póster, otro)

Ponencia - Paper

ISSN/ISBN

978-84-6900-551-4

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE 484

HASTA 497

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Albacete

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/06

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

E. Mejía-Roa, J. I. Gómez, M. Prieto, A. Pascual-Montano, F. Tirado

TÍTULO

Non-negative Matrix Factorization on graphics cards and its application in Bioinformatics

ENTIDAD ORGANIZADORA

Red Temática Nacional de Bioinformática / Universidad de Zaragoza

CONGRESO:

VII Jornadas de Bioinformática

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), póster, otro)

Póster

ISSN/ISBN

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE

HASTA

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Zaragoza

FECHA DE CELEBRACIÓN

11/06

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

E. Mejia-Roa, M. Vazquez, P. Carmona-Saez, C. Garcia, F. Tirado, A. Pascual-Montano

TÍTULO

bioNMF-grid: An online grid-based tool for Non-negative Matrix Factorization in Biology

ENTIDAD ORGANIZADORA

EELA-2 Project

CONGRESO:

Second EELA-2 Conference

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - paper

ISSN/ISBN

978-84-7834-627-1

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE 133

HASTA 139

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Choroní, Venezuela

FECHA DE CELEBRACIÓN

11/09

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): el proyecto EELA-2 (E-science grid facility for Europe and Latin America) está financiado por la CE a través del 7FP.

AUTORES

E. Mejía-Roa, C. García, J. I. Gómez, M. Prieto, C. Tenllado, A. Pascual-Montano, F. Tirado

TÍTULO

Parallelism on the Nonnegative Matrix Factorization

ENTIDAD ORGANIZADORA

Universidad de Gante

CONGRESO:

14th Biennial International Conference on Parallel Computing (ParCo 2011)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia – paper

ISSN/ISBN

978-1-61499-041-3

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE 421

HASTA 428

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Gante (Bélgica)

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/11

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso: Aminer.org

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe): 29

Nº de congresos en el ranking (si existe): 91

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): Factor H5: 21,00

AUTORES

E. Mejía-Roa, C. García, J. I. Gómez, M. Prieto, F. Tirado, R. Nogales, A. Pascual-Montano

TÍTULO

Biclustering and classification analysis in gene expression using Nonnegative Matrix Factorization on multi-GPU systems

ENTIDAD ORGANIZADORA

Universidad de Córdoba / MIR Labs / IEEE

CONGRESO:

11th International Conference on Intelligent Systems Design and Applications (ISDA)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - paper

ISSN/ISBN

978-1-4577-1676-8

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE 882

HASTA 887

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Córdoba, España

FECHA DE CELEBRACIÓN

11/11

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  CORE

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+): C

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): Categoría: “Artificial Intelligence and Image Processing”

AUTORES

E. Mejía-Roa, C. García, A. Pascual-Montano, F. Tirado

TÍTULO

Paralelismo en la factorización NMF

ENTIDAD ORGANIZADORA

Sociedad de Arquitectura y Tecnología de Computadores (SARTECO) / UCM

CONGRESO:

XXIV Jornadas de Paralelismo

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia – paper

ISSN/ISBN

978-84-695-8330-2

VOLUMEN

PÁGINAS

DESDE 312

HASTA 317

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Madrid, España

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/13

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):