Datos de la tesis doctoral

Facultad de Informática

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DATOS DE LA TESIS

  
 

Titulo

Aplicación de métodos de aprendizaje automático para el estudio de la comorbilidad inversa

entre cáncer y trastornos del sistema nervioso central

 
 

Doctorando

Kristina Ibáñez Garikano

 
 

Director(es)

Gonzalo Pajares Martinsanz, María Guijarro Mata-García, Alfonso Valencia Herrera

 
 

Universidad

Universidad Complutense de Madrid

 
 

Año de lectura

2015

 
 

Doctorado europeo (si/no)

No

 
    
 

Publicaciones de la tesis

  
    
 

a) Revistas

  
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Boullosa C., Tabarés-Seisdedos R.,Baudot A., Valencia A.

 
 

Nº DE AUTORES

5

 
 

TÍTULO

Molecular Evidence for the Inverse Comorbidity between Central Nervous System Disorders

and Cancers Detected by Transcriptomic Meta-analyses

 
 

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

 
 

NOMBRE DE LA REVISTA

PLoS Genetics

 
 

VOLUMEN

10

 
 

PÁGINAS

DESDE e1004173

 
 

HASTA e1004173

 
 

EDITORIAL

Public Library of Science

 
 

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Estados Unidos

 
 

AÑO DE PUBLICACIÓN

2014

 
 

ISSN

1553-7404

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: GENETICS & HEREDITY

 
 

ÍNDICE DE IMPACTO: =7,528 (2014)

 
 

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 14

 
 

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 167

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 18

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Guijarro M., Pajares G., Valencia A.

 
 

Nº DE AUTORES

4

 
 

TÍTULO

A computational approach inspired by simulated annealing to study the stability of protein interaction networks in cancer and neurological disorders.

 
 

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

 
 

NOMBRE DE LA REVISTA

Data Mining and Knowledge Discovery

 
 

VOLUMEN

40

 
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

EDITORIAL

Springer

 
 

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Estados Unidos

 
 

AÑO DE PUBLICACIÓN

2015

 
 

ISSN

1384-5810

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: Computer Science, Information Systems; Computer Science, Artificial Intelligence

 
 

ÍNDICE DE IMPACTO: 1.987 (2014)

 
 

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: Computer Science, Information Systems (25) ; Computer Science, Artificial Intelligence (41)

 
 

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: Computer Science, Information Systems (139); Computer Science, Artificial Intelligence (123)  

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 0

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Marta M. Kamieniak,Daniel Rico,Roger L. Milne,Ivan Muñoz-Repeto,Kristina Ibáñez,Miguel A. Grillo,Samuel Domingo,Salud Borrego,Alicia Cazorla,José M. García-Bueno,Hernando S,García-Donas J,Hernández-Agudo E,Y Cajal TR,Robles-Díaz L,Márquez-Rodas I,Maite Cusidó,Raquel Sáez,Carmen Lacambra-Calvet,Ana Osorio,Miguel Urioste,Juan C. Cigudosa,Luis Paz-Ares,José Palacios,Javier Benítez,María J. García

 
 

Nº DE AUTORES

26

 
 

TITULO

Deletion at 6q24.2-26 predicts longer survival of high-grade serous epithelial ovarian cancer patients

 
 

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

 
 

NOMBRE DE LA REVISTA

Molecular Oncology

 
 

VOLUMEN

9

 
 

PÁGINAS

422-436

 
 

Elsevier

 
 

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Estados Unidos

 
 

AÑO DE PUBLICACIÓN

2015

 
 

ISSN

1878-0261

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: Oncology

 
  

ÍNDICE DE IMPACTO: 5.33 (2014)

 
 

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 28

 
 

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 211

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 0

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Tirso Pons,Ida Paramonov,César Boullosa,Kristina Ibáñez,Ana M. Rojas,Alfonso Valencia

 
 

Nº DE AUTORES

6

 
 

TITULO

 A common structural scaffold in CTD phosphatases that supports distinct catalytic mechanisms

 
 

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

 
 

NOMBRE DE LA REVISTA

Proteins Structure Function and Bioinformatics

 
 

VOLUMEN

82

 
 

PÁGINAS

113-118

 
 

Elsevier

 
 

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Estados Unidos

 
 

AÑO DE PUBLICACIÓN

2014

 
 

ISSN

1097-0134

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR:

 
  

ÍNDICE DE IMPACTO: 2.63

 
 

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: Biochemistry and molecular biology (148); Biophysics (37)

 
 

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: Biochemistry and molecular biology (289); Biophysics (73)

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 0

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Milana Frenkel-Morgenstern,Alessandro Gorohovski,Vincent Lacroix,Mark Rogers,Kristina Ibanez,Cesar Boullosa,Eduardo Andres Leon,Asa Ben-Hur,Alfonso Valencia

 
 

Nº DE AUTORES

9

 
 

TITULO

ChiTaRS: a database of human, mouse and fruit fly chimeric transcripts and RNA-sequencing data

 
 

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

 
 

NOMBRE DE LA REVISTA

Nucleic Acids Research

 
 

VOLUMEN

41

 
 

PÁGINAS

142-151

 
 

Oxford University Press

 
 

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Reino Unido

 
 

AÑO DE PUBLICACIÓN

2012

 
 

ISSN

0305-1048

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: Biochemistry and molecular biology

 
  

ÍNDICE DE IMPACTO: 9.11

 
 

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 20

 
 

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 289

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. Autocitas): 11

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

c) Ponencias

  
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Guijarro M., Pajares G., Valencia A.

 
 

TÍTULO

Stability of Cancer and Alzheimer's Interaction Networks, a Simulated Annealing based Approach

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Intelligent Systems for Molecular Biology (ISMB)

 
 

CONGRESO:

Network Biology-SIG

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Boston (EEUU)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

07/14

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Boullosa C., Tabarés-Seisdedos R., Baudot A., Valencia A.

 
 

TÍTULO

Inverse Comorbidity between Central Nervous System Disorders and Cancers interpreted by Transcriptomic Meta-analyses

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Spanish Institute of Bioinformatics and the Portuguese Bioinformatics Network

 
 

CONGRESO:

XII Spanish Symposium on Bioinformatics

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia invitada

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Sevilla (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/14

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Silla-Castro JC., Lapunzina P., del Pozo A.

 
 

TÍTULO

Detection of Large Copy Number Variation Algorithm using Read-Depth of Coverage in Fitted Panels of Genes

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Spanish Institute of Bioinformatics and the Portuguese Bioinformatics Network

 
 

CONGRESO:

XII Spanish Symposium on Bioinformatics

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Sevilla (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/14

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Silla-Castro JC., Martin-Arenas R., Barroso E., Del Pozo A.

 
 

TÍTULO

Characterization of Patterns in Dravet Syndrome combining Next Generation Sequencing,

Clinical Data and Machine Learning techniques

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

International Society for Computacional Biology (ISCB)

 
 

CONGRESO:

23rd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Dublín (Irlanda)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

07/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Silla-Castro JC., Ibáñez K., Lapunzina P Del Pozo A.

 
 

TÍTULO

RAMBO: Really Accessible Management of Bioinformatics Outcome in massive parallel

sequencing for clinical studies

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

International Society for Computacional Biology (ISCB)

 
 

CONGRESO:

23rd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Dublín (Irlanda)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

07/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Del Pozo A., Ibáñez K., Silla-Castro JC., Lapunzina P.

 
 

TÍTULO

A non-invasive bioinformatic method for analysis of fetal aneuploidy in maternal blood

by Next Generation Sequencing

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

International Society for Computacional Biology (ISCB)

 
 

CONGRESO:

23rd International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Dublín (Irlanda)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

07/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Ibáñez K., Silla-Castro JC., Lapunzina P Del Pozo A.

 
 

TÍTULO

LACONv, Método Para la Detección de Variación en número de copia usando la cobertura de las lecturas de ADN en paneles personalizados de genes en secuenciación masiva

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Asociación Española de Genética Humana (AEGH)

 
 

CONGRESO:

XXVIII Congreso Nacional de Genética Humana

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Mallorca (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

05/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Del Pozo A., Ibáñez K., Silla-Castro JC., F.Montaño VE., Campos-Barros A.,Moreno JC., Heath KE., González-Casado I., Aguado B., Luna A., Nevado J.,Vallespín E., Lapunzina P.

 
 

TÍTULO

Secuenciación Masiva en la Práctica Clínica: Ajuste de la técnica en una cohorte de pacientes

con patología endocrina

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Asociación Española de Genética Humana (AEGH)

 
 

CONGRESO:

XXVIII Congreso Nacional de Genética Humana

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Mallorca (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

05/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Del Pozo A., Silla-Castro JC., Ibáñez K., Lapunzina P.

 
 

TÍTULO

Estudio de los predictores de patogenicidad in-silico para guiar el diagnóstico en NGS

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Asociación Española de Genética Humana (AEGH)

 
 

CONGRESO:

XXVIII Congreso Nacional de Genética Humana

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Mallorca (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

05/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Prieto-Arribas D., Del Pozo A., Ibáñez K., Silla-Castro JC., Vallespín E., Fernández-Montaño VF., Mori AM., Mansilla E., Rodríguez R., Nevado J., de Torres ML.,Lapunzina P., García-Santiago F.

 
 

TÍTULO

Método no invasivo para el análisis de aneuploidías fetales en sangre materna mediante NGS

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Asociación Española de Genética Humana (AEGH)

 
 

CONGRESO:

XXVIII Congreso Nacional de Genética Humana

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Mallorca (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

05/15

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):

 
    
 

AUTORES

Del Pozo A., Silla-Castro JC., Ibáñez K., Campos-Barro A., Moreno JC., Heath K.,Nevado J.,

Fdez-Montaño ME., Vallespín E., Lapunzina P.

 
 

TÍTULO

Next Generation Sequencing in Clinical Practice: Challenges and Promises in a Cohort of

Endocrine Patients

 
 

ENTIDAD ORGANIZADORA

Spanish Institute of Bioinformatics and the Portuguese Bioinformatics Network

 
 

CONGRESO:

XII Spanish Symposium on Bioinformatics

 
 

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Póster

 
 

ISSN/ISBN

  
 

VOLUMEN

  
 

PÁGINAS

DESDE

 
 

HASTA

 
 

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Sevilla (España)

 
 

FECHA DE CELEBRACIÓN

09/14

 
 

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:  

 
 

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

 
 

Posición del congreso en el ranking (si existe):

 
 

Nº de congresos en el ranking (si existe):

 
 

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

 
 

OTROS INDICIOS (si se sabe):