Datos de la tesis doctoral

DATOS DE LA TESIS

Titulo

Enhancing automatic extraction of biomedical relations using different linguistic features extracted from text

Doctorando

Behrouz Bokharaeian

Director(es)

Alberto Diaz

Universidad

Universidad Complutense de Madrid

Año de lectura

2017

Doctorado europeo (si/no)

no

Publicaciones de la tesis

a) Revistas

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz, Hamidreza Chitsaz

Nº DE AUTORES

3

TÍTULO

Enhancing Extraction of Drug-Drug Interaction from Literature Using Neutral Candidates, Negation, and Clause Dependency

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

PLoS ONE

VOLUMEN

11 (10)

PÁGINAS

20

doi:10.1371/journal.pone.0163480

EDITORIAL

Public Library of Science

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Estados Unidos

AÑO DE PUBLICACIÓN

2016

ISSN

1932-6203

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: MULTIDISCIPLINARY SCIENCES (JCR 2015)

ÍNDICE DE IMPACTO: 3.057

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 11 (Q1)

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 63

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): SJR 2015: 1.395, 209/1779 (Q1) MEDICINE (MISCELLANOUS)

AUTORES

Behrouz Bokharaeian; Alberto Diaz; Nasrin Taghizadeh; Hamidreza Chitsaz; Ramyar Chavoshinejad

Nº DE AUTORES

5

TÍTULO

SNPPhenA: A Corpus for Extracting Ranked Associations of Single Nucleotide Polymorphisms and Phenotypes from Literature

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Journal of Biomedical Semantics

VOLUMEN

8 (14)

PÁGINAS

13

doi: 10.1186/s13326-017-0116-2

EDITORIAL

Biomed Central Ltd

PAÍS DE PUBLICACIÓN

England

AÑO DE PUBLICACIÓN

2017

ISSN

2041-1480

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR: MATHEMATICAL & COMPUTATIONAL BIOLOGY (JCR 2015)

ÍNDICE DE IMPACTO: 1.620

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA: 22 (Q2)

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA: 56

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): SJR 2015: 0.903, 60/819 (Q1) INFORMATION SYSTEMS

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Díaz, Miguel Ballesteros

Nº DE AUTORES

3

TÍTULO

Extracting Drug-Drug Interaction from Text Using Negation Features

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Procesamiento del Lenguaje Natural

VOLUMEN

51

PÁGINAS

DESDE 49

HASTA 56

EDITORIAL

Sociedad Española para el Procesamiento del Lenguaje Natural

PAÍS DE PUBLICACIÓN

España

AÑO DE PUBLICACIÓN

2013

ISSN

1135-5948

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR:

ÍNDICE DE IMPACTO:

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA:

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA:

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): SJR 2013: 0.137, 328/627 (Q2) LINGUISTICS AND LANGUAGE

AUTORES

R.A. Kadir, B. Bokharaeian

Nº DE AUTORES

2

TÍTULO

Overview of Biomedical Relations Extraction using Hybrid Rule-based Approaches

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Journal of Industrial and Intelligent Information

VOLUMEN

1(3)

PÁGINAS

DESDE 169

HASTA 173

EDITORIAL

Universiti Putra Malaysia

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Malaysia

AÑO DE PUBLICACIÓN

2013

ISSN

2301-3745

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR:

ÍNDICE DE IMPACTO:

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA:

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA:

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):6

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

B. Bokharaeian; A. Diaz

Nº DE AUTORES

2

TÍTULO

Extraction of Drug-Drug Interaction from Literature through Detecting Linguistic-Based Negation and Clause Dependency

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Journal of Artificial Intelligence and Data Mining (JAIDM)

VOLUMEN

4(2)

PÁGINAS

DESDE 203

HASTA 212

EDITORIAL

Shahrood University of Technology

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Irán

AÑO DE PUBLICACIÓN

2016

ISSN

2322-5211

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR:

ÍNDICE DE IMPACTO:

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA:

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA:

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe): Universal Impact Factor: 0.1266

AUTORES

B. Bokharaeian; A. Diaz

Nº DE AUTORES

2

TÍTULO

Automatic Extraction of Ranked SNP-Phenotype Associations from Literature through Detecting Neural Candidates, Negation, and Modality Markers

CLAVE (Artículo, Artículo de revisión, editor)

Artículo

NOMBRE DE LA REVISTA

Journal of Artificial Intelligence and Data Mining (JAIDM)

VOLUMEN

Under Review

PÁGINAS

EDITORIAL

Shahrood University of Technology

PAÍS DE PUBLICACIÓN

Irán

AÑO DE PUBLICACIÓN

ISSN

2322-5211

INDICIOS DE CALIDAD

AREA de JCR:

ÍNDICE DE IMPACTO:

POSICIÓN QUE OCUPA LA REVISTA EN EL ÁREA:

Nº DE REVISTAS EN EL ÁREA:

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

c) Ponencias

AUTORES

B. Bokharaeian, A Diaz

TÍTULO

NIL_UCM: Extracting Drug-Drug Interactions from Text through Combination of Sequence and Tree Kernels

ENTIDAD ORGANIZADORA

Association for Computational Linguistics

CONGRESO:

The Second Joint Conference on Lexical and Computational Semantics (SemEval)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Poster - Paper

ISSN/ISBN

978-1-937284-48-0

VOLUMEN

https://www.aclweb.org/anthology/S/S13/S13-2.pdf#page=680

PÁGINAS

DESDE 644

HASTA 650

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Atlanta, Georgia, USA

FECHA DE CELEBRACIÓN

junio-13

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):10

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz, Mariana Neves, Virginia Francisco

TÍTULO

Exploring Negation Annotations in the DrugDDI Corpus

ENTIDAD ORGANIZADORA

European Language Resources Association

CONGRESO:

Fourth Workshop on Building and Evaluating Resources for

Health and Biomedical Text Processing (LREC)

Fourth Workshop on Building and Evaluating Resources for

Health and Biomedical Text Processing (LREC)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Poster - Paper

ISSN/ISBN

978-1-937284-48-0

VOLUMEN

http://www.lrec-conf.org/proceedings/lrec2014/workshops/LREC2014Workshop-BioTxtM2014%20Proceedings.pdf

PÁGINAS

DESDE 84

HASTA 92

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Reykjavík, Iceland

FECHA DE CELEBRACIÓN

mayo-14

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):10

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz

TÍTULO

Automatic Extraction of SNP-Trait Associations from Text through Detecting Linguistics-Based Negation

ENTIDAD ORGANIZADORA

Iranian Fuzzy  Systems Society (IFSS) and Intelligent Systems Society of Iran ( ISSSI )

CONGRESO:

4th Iranian Joint Congress on Fuzzy and Intelligent Systems (CFIS)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - Paper

ISSN/ISBN

978-1-4673-8545-9

VOLUMEN

http://ieeexplore.ieee.org/document/7391681/

PÁGINAS

DESDE 1

HASTA 5

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Zahedan-Iran

FECHA DE CELEBRACIÓN

septiembre-15

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz

TÍTULO

Automatic Extraction of Drug-Drug Interaction from Literature through Detecting Clause Dependency and Linguistics-Based Negation

ENTIDAD ORGANIZADORA

Center of Excellence in Digital Processing Systems Of Iran

CONGRESO:

Signal Processing and Intelligent Systems Conference (SPIS)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - Paper

ISSN/ISBN

978-1-5090-0139-2

VOLUMEN

http://ieeexplore.ieee.org/document/7422306/

PÁGINAS

DESDE 25

HASTA 30

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Tehran-Iran

FECHA DE CELEBRACIÓN

diciembre-15

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz

TÍTULO

An annotated corpus for extracting the phenotypic plasticity and the association of SNP-Phenotypes from the text

ENTIDAD ORGANIZADORA

Center of Excellence in Digital Processing Systems Of Iran

CONGRESO:

2nd International Conference of Signal Processing and Intelligent System (ICSPIS)

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - Paper

ISSN/ISBN

978-1-5090-0139-2

VOLUMEN

http://ieeexplore.ieee.org/document/7869852/

PÁGINAS

DESDE 1

HASTA 6

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Tehran-Iran

FECHA DE CELEBRACIÓN

Diciembre, 2016

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):

AUTORES

Behrouz Bokharaeian, Alberto Diaz, Hamidreza Chitsaz

TÍTULO

The SNPPhenA Corpus: An Annotated Research Abstract Corpus for Extracting Ranked Association of Single-Nucleotide Polymorphisms and Phenotypes

ENTIDAD ORGANIZADORA

International Society for Computational Biology (ISCB)

CONGRESO:

14th Annual Rocky Mountain Bioinformatics Conference

TIPO DE PARTICIPACIÓN (Ponencia (paper), ponencia invitada (inv spaker), poster, otro)

Ponencia - poster

ISSN/ISBN

https://www.iscb.org/cms_addon/conferences/rocky2016/track/posters.php

VOLUMEN

PÁGINAS

LUGAR DE CELEBRACIÓN

Colorado, USA

FECHA DE CELEBRACIÓN

Diciembre, 2016

INDICIOS DE CALIDAD

Nombre del ranking donde se incluye el congreso:

Categoría del congreso (si existe; p.ej. A, A+):

Posición del congreso en el ranking (si existe):

Nº de congresos en el ranking (si existe):

Nº DE CITAS (si se sabe, excl. autocitas):

OTROS INDICIOS (si se sabe):